La maladie de Parkinson affecte les nerfs qui sécrètent la dopamine. Il détruit le nerf transféré de la substance piégée dans le cerveau moyen vers les noyaux gris centraux. En anatomie post mortem, le matériau piégé est affecté par la disparition de la mélanine
Au microscope, il y a une perte de beaucoup de nerfs dans la zone de la substance, et lors de l’examen microscopique des nerfs restants, il y a des objets distincts dans ces neurones appelés corps de Lewy. Les symptômes de la maladie de Parkinson surviennent généralement après 60 à 80% Lorsque la dopamine est perdue, les autres neurotransmetteurs augmentent en particulier le transporteur cholinergique, car une carence en dopamine et un transport cholinergique accru conduisent à la maladie de Parkinson.